Biobanco Vasco

I+D+i Biobanking

El incremento de la demanda de muestras biológicas y datos clínicos asociados de alta calidad para investigación biomédica conlleva que los biobancos, además de ser plataformas de apoyo a la investigación, desarrollen una I+D propia para mejorar sus procesos. En este sentido, el Biobanco Vasco define en su plan estratégico 2012-2017 la apuesta por la I+D con el objetivo de mejorar sus servicios y su sostenibilidad.


El Biobanco Vasco tiene dos líneas de I+D+i en biobancos:

1.    Estudio de las variables preanalíticas que afectan a la calidad de las muestras
Casi todos los tipos de muestra biológica consiste en células vivas o moléculas en suspensión que derivan de estas células. Estas muestras pueden alterarse cuando están sujetas a cambios o elementos de estrés durante la obtención, procesamiento, almacenamiento y trasporte/entrega al investigador. Además, otros factores pueden cambiar la estabilidad de las muestras como pueden ser por ejemplo, la toma de sangre, el procedimiento quirúrgico o la autopsia. Estas variables afectan sensiblemente la composición molecular de la muestra en un espacio corto de tiempo y ponen en peligro la correcta interpretación de los resultados obtenidos con dichos bioespecímenes. Nuestro objetivo es aportar conocimiento sobre estas variables preanalíticas y nuevas estrategias de procesamiento de muestras.

2.    Big data y motores de búsqueda de muestras biológicas en redes de biobancos.
Queremos basarnos en las nuevas tecnologías de la información y en las habilidades en el uso de Big Data para resolver problemas complejos relacionados con el descubrimiento científico e investigación biomédica.
En esta línea el Biobanco Vasco lidera el proyecto europeo BIOPOOL (www.biopoolproject.eu), cuyo fin ha sido el desarrollo de un buscador de muestras biológicas en una red de biobancos, mediante técnicas de visión artificial y semántica. Así, el investigador puede buscar en una red de biobancos, imágenes que coinciden con la imagen y los datos de la muestra de interés. Como resultado, el usuario recibe el listado de imágenes semejantes y los biobancos que las tienen para que se ponga en contacto y si lo desea, las solicite.
El proyecto ha sido financiado por la comisión europea bajo el Séptimo programa marco (2012-2014). El consorcio BIOPOOL ha unido la amplia experiencia de 7 socios (Biobanco Vasco-BIOEF), TECNALIA, eMedica, Cultek, EMC biobank, Pertimm, Brunel University) provenientes de 4 países de la comunidad Europe. Actualmente se está llevando a cabo una ampliación a nivel de número de biobancos de la red, así como la inclusión de nuevas patologías y tipos de tinción/imagen.

Además de la actividad propia, el Biobanco Vasco coordina la I+D+i de la Plataforma Nacional de Biobancos del Instituto de Salud Carlos III.

Para ampliar información sobre la actividad del Biobanco Vasco se puede consultar (Aaro Tupasela & cols. Review 322/2015: Patients, Business and the State; Tupasela et al., “Constructing populations in biobanking” Life Sciences, Society and Policy (2015) 11:5).).


Publicaciones relevantes del Biobanco Vasco sobre “science biobanking”:

•    Methodological aspects of the molecular and histological study of prostate cancer: focus on PTEN. Methods. 2015 May;77-78:25-30

•    Digitalisation of histological images. Hospital Health Care. 2014 209-:212

•    Sources of pre-analytical variations in yield of DNA extracted from blood samples: analysis of 50,000 DNA samples in EPIC. PLoS One. 2012;7(7):e39821.

 

Para más información:

Visite la web de Biopool www.biopoolproject.eu
o contacte con Roberto Bilbao:
biobancovasco@bioef.org 
+34 944 536 890

 Biopool_logo fp7logoban 

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