replica rolex persists in the spirit of exploration all along.

Biobanco Vasco - PICCOLO RGB/NBI en muestras biológicas

Biobanco Vasco

PICCOLO RGB/NBI en muestras biológicas

PICCOLO RGB NBI

Figura: Ejemplos de imágenes y máscaras de la base de datos PICCOLO RGB/NBI

 

* Descripción general:

Esta base de datos contiene 3433 imágenes de colonoscopias; incluyendo imágenes de banda estrecha o narrow band imaging (NBI) e imágenes de luz blanca. Se incluyen 70 lesiones diferentes de un total de 48 pacientes. Para cada una de las lesiones, se incluyen igualmente los resultados clínicos correspondientes. 

* Detalles técnicos:

La base de datos PICCOLO contiene imágenes de 70 lesiones que han sido extraídas de 40 vídeos de colonoscopias. De la misma manera, también se han incluido los datos clínicos más relevantes. Para cada uno de los vídeos de las lesiones están disponibles los siguientes datos:


Proporcionados por el clínico gastroenterólogo:
1. Número de pólipos de interés encontrados durante la exploración
2. Identificación del pólipo
3. Tamaño del pólipo (mm)
4. Clasificación de Paris
5. Clasificación NICE
Proporcionados por el histopatólogo:
6. Diagnóstico final
7. Estratificación histológica

Se incluyen imágenes de luz blanca e imágenes de banda estrecha en formato .png. Para cada una de las imágenes, se ha creado manualmente una máscara binaria indicando el área del pólipo dentro de la imagen y una máscara binaria indicando el área negra de la imagen endoscópica (void), ambas en formato .tif. En total, hay 3433 imágenes con sus correspondientes máscaras binarias para pólipo y void. La base de datos tiene un tamaño aproximado de 3.2 GB y se enviará en formato .zip. 

Para acceder a las imágenes es necesario rellenar el siguiente formulario https://forms.office.com/r/cgbMgHbYH4 o contactar con el Biobanco Vasco en solicitudes.biobancovasco@bioef.eus donde se informará de las condiciones de acceso.  

Por favor, cita la siguiente referencia cuando uses esta base de datos:
Sánchez-Peralta, L.F.; Pagador, J.B.; Picón, A.; Calderón, Á.J.; Polo, F.; Andraka, N.; Bilbao, R.; Glover, B.; Saratxaga, C.L.; Sánchez-Margallo, F.M. PICCOLO White-Light and Narrow-Band Imaging Colonoscopic Dataset: A Performance Comparative of Models and Datasets. Appl. Sci. 2020, 10, 8501. https://doi.org/10.3390/app10238501

Las colecciones del Biobanco en los medios

El Biobanco Vasco en los medios